Сопровождение налоговой проверки по самозанятым: курьерская доставка и логистика

Если вы гендиректор логистической или курьерской компании и ФНС запросила пояснения по выплатам самозанятым — это не рядовой запрос: отрасль входит в приоритетный список скоринга. При переквалификации договоров компания доначисляет НДФЛ 13% и страховые взносы 30% с каждой выплаты, а уплаченный курьерами НПД 6% в счёт этих сумм не зачитывается — такова позиция Верховного суда (определение от 03.02.2025 № 309-ЭС24-20306).

Курьерская доставка и логистика — один из самых уязвимых сегментов по числу признаков подмены трудовых отношений: массовая и однотипная работа исполнителей по ГПХ, регулярные равные выплаты, контроль через трекер и диспетчера. ФНС применяет автоматический скоринг по критериям письма № ЕА-4-15/4674@, и отраслевой риск-профиль здесь выше среднего. На этой странице — как CAUTIO сопровождает налоговую проверку по самозанятым в курьерской доставке и логистике: от первого запроса до урегулирования.

Почему курьерская и логистика — зона повышенного внимания ФНС?

Массовая работа с исполнителями по ГПХ и НПД характерна для всей отрасли. Именно поэтому аргумент «в нашей отрасли так работают все» не снижает риск — он его повышает: ФНС видит отраслевой паттерн и проверяет его системно.

Признаки трудовых отношений, которые суды и налоговая выявляют в договорах с курьерами и водителями на НПД:

Каждый из этих признаков описан в Постановлении Пленума ВС РФ № 15 от 29.05.2018 и в письме ФНС № ЕА-4-15/4674@. Совокупность трёх и более признаков образует основание для переквалификации по ст. 19.1 ТК РФ. При этом неустранимые сомнения толкуются в пользу трудовых отношений — бремя доказывания реального ГПХ лежит на компании.

Как выглядит налоговая проверка в отрасли: три сценария

Сценарий 1: запрос пояснений по выплатам самозанятым. ФНС направляет требование предоставить пояснения к договорам с конкретным перечнем исполнителей. Типичная ситуация — скоринг зафиксировал: более 10 физлиц получают регулярные равные суммы от одной компании. Без подготовленной позиции компания рискует дать ответ, который сам по себе подтвердит признаки трудовых. Юристы CAUTIO анализируют договоры и выплаты, выявляют критические маркеры и готовят пояснения с правовой аргументацией реальности услуг.

Сценарий 2: акт проверки с доначислением. По итогам камеральной или выездной проверки налоговый орган составляет акт с доначислением НДФЛ и страховых взносов. В одном из дел в Уральском федеральном округе (2024) логистическая компания получила доначисление в несколько миллионов рублей по 30 с лишним исполнителям — суммарно НДФЛ 13%, взносы 30%, пени и штраф 40% по ст. 122 НК РФ. Уплаченный самозанятыми НПД не был засчитан (позиция ВС, определение № 309-ЭС24-20306 от 03.02.2025). CAUTIO оценивает перспективы обжалования, готовит возражения на акт и жалобу в вышестоящий налоговый орган.

Сценарий 3: иск исполнителя о признании отношений трудовыми. Бывший курьер обращается в суд или ГИТ с требованием признать работу по ГПХ трудовой. Если суд признаёт отношения трудовыми с даты фактического допуска (ст. 19.1 ТК РФ), это автоматически открывает налоговые последствия. CAUTIO выстраивает защиту от признания отношений трудовыми и координирует позицию с налоговым риском.

Получили запрос ФНС по выплатам курьерам или водителям на НПД? Промедление с ответом усиливает позицию налоговой.

Заказать аудит договоров ГПХ

Что конкретно делают юристы CAUTIO

Сопровождение налоговой проверки по самозанятым в курьерской доставке и логистике включает несколько последовательных этапов.

Анализ базы договоров и выплат
Проверяем договоры ГПХ и НПД-чеки по критериям ФНС (письмо № ЕА-4-15/4674@) и признакам Пленума ВС № 15. Выявляем исполнителей с критическим риском-профилем: единственный заказчик, фиксированный режим, регулярные равные суммы.
Подготовка позиции и пояснений
Формируем правовую аргументацию реальности услуг: результат, а не трудовая функция; предпринимательская самостоятельность исполнителя; отсутствие подчинения внутреннему распорядку. Готовим ответ на требование ФНС или пояснения для межведомственной комиссии.
Сопровождение проверочных мероприятий
Представляем компанию при истребовании документов, на допросах, при выездных мероприятиях. Контролируем, чтобы процессуальные нарушения со стороны налоговой фиксировались и использовались в защите.
Возражения на акт и обжалование
Если акт составлен — готовим возражения в установленный срок, жалобу в УФНС, при необходимости — заявление в арбитражный суд.
Приведение документооборота в безопасную форму
По итогам проверки — исправляем маркеры, которые спровоцировали риск: договоры, акты, регламенты взаимодействия с исполнителями. Инструментарий: безопасный документооборот с внештатным персоналом.

Если компания работает с десятками курьеров на НПД и не проводила аудит договоров — риск уже существует, проверка лишь его выявит.

Заказать аудит договоров ГПХ

Чек-лист: что подготовить до ответа на запрос ФНС

Направления практики по теме

Частые вопросы

1. Какие риски у нашей отрасли при работе с самозанятыми?

Курьерская доставка и логистика входят в число отраслей с наиболее высоким риск-профилем по переквалификации. Признаки трудовых отношений здесь системны: постоянный маршрут, фиксированный график, форменная одежда заказчика, контроль через трекер. Эти признаки совпадают с перечнем Постановления Пленума ВС РФ № 15 от 29.05.2018 и критериями письма ФНС № ЕА-4-15/4674@. Один исполнитель с такими признаками создаёт прецедент для проверки всей базы.

2. Как ФНС проверяет компании в этой сфере?

ФНС применяет автоматический скоринг по критериям письма № ЕА-4-15/4674@: массовость выплат физлицам, регулярность и равномерность перечислений, единственный источник дохода у исполнителей. Для логистики и курьерских сервисов скоринг срабатывает быстро из-за большого числа однотипных исполнителей и регулярных выплат. После скоринга следует требование пояснений, затем — выездная или камеральная проверка.

3. Что грозит при массовой работе с исполнителями?

При переквалификации договоров компания доначисляет НДФЛ 13% и страховые взносы 30% со всей суммы выплат, плюс пени по ст. 75 НК РФ и штраф 20–40% по ст. 122 НК РФ. При этом уплаченный самозанятыми НПД 6% не зачитывается в счёт НДФЛ работодателя — такова позиция Верховного суда (определение от 03.02.2025 № 309-ЭС24-20306). Административная ответственность по ч. 4 ст. 5.27 КоАП — ещё 50 000–100 000 рублей на юрлицо.

4. Как снизить риск переквалификации?

Ключевые направления: устранить признаки подчинения (жёсткий маршрут, обязательный график, инструктаж как у штатного сотрудника), зафиксировать предпринимательскую самостоятельность исполнителя в договоре и актах, исключить организационную зависимость — форменную одежду только заказчика, работу исключительно на одну компанию. Документооборот должен отражать реальный характер услуг, а не трудовую функцию. Аудит договоров позволяет выявить критические маркеры до проверки.

5. Нужен ли аудит договоров?

Если компания работает более чем с 10–15 самозанятыми в сфере курьерской доставки или логистики и производит регулярные выплаты, аудит договоров обоснован. Он позволяет выявить конкретные маркеры переквалификации в договорах, актах и регламентах, оценить суммарный налоговый риск и получить рекомендации по приведению документооборота в безопасную форму — до того, как ФНС запросит пояснения.

Есть договоры с самозанятыми, риск которых хотите оценить?

Проанализируем договоры ГПХ и НПД-выплаты по критериям ФНС, выявим маркеры переквалификации и оценим суммарный налоговый риск. Если проверка уже началась — готовим позицию и пояснения. Практика по налоговым и трудовым спорам.

Заказать аудит договоров ГПХ

Автор статьи

Анна Смирнова, партнёр, руководитель налоговой практики

Специализация — налоговые последствия переквалификации, доначисления НДФЛ и страховых взносов, зачёт НПД, сопровождение налоговых проверок и споров с ФНС.

17 января 2026 года